La Subdirección de Planeación, es un puesto que tiene la encomienda de coordinar las actividades de planeación, programación y presupuestación, supervisar el correcto desarrollo de las juntas del Órgano de Gobierno, supervisar y coordinar las actividades de las Jefaturas de los Departamentos de Control Escolar, Planeación Programación y Presupuestación y del Centro de Información. Establecer políticas de aplicación de la Estructura Académica, Administrativa y de Servicios. Esta Subdirección mantiene contacto directo con las Áreas de Administración y Académica y esta subordinada a la Dirección de Planeación y Vinculación.